Ci sono 106 specie degli anfibi e dei rettili in Egitto; sei sono endemiche e una minacciata:(la tartaruga egiziana).
I rettili più numerosi sono 49 specie di lucertole; I Gekkonidae ne sono il gruppo più numeroso. Tra le 36 specie dei serpenti, nove sono velenosi e altri nove sono serpenti di posteriori denti veleniferi che sono anche velenosi, malgrado siano meno pericolosi per gli esseri umani a causa della necessità di ottenere una parte della vittima al di dietro delle loro mascelle, al fine di iniettare il veleno.
Le cinque specie delle tartarughe marine trovate nelle acque egiziane sono tutte minacciate a livello globale. Entrambi la Tartaruga verde e la (Eretmochelys imbricata)  nidificano sulle sponde d'Egitto o sulle isole egiziane.

Cinque specie dei rospi (Bufonidae), di cui una è endemica, sono unite da una raganella degli alberi e da due altre specie dei rospi. L'impressionante coccodrillo del Nilo (Crocodylus niloticus), una volta comune lungo il Nilo, è ora trovato solo nel lago di Nasser, insieme con il gran Monitor del Nilo (Varanus niloticus)  e la Tartaruga del Nilo (Trionyx triunguis).

1 of 24 Nile Valley Toad, Bufo kassasii

Una specie nuovamente descritta che è abbondante nelle zone umide del Delta. Essa è di dimensioni piuttosto ridotte con una massima lunghezza registrata di 4 centimetri. Il maschio fa un sonaglio distintivo come chiamata. Questo rospo abita nelle paludi alluvionate e nei campi di riso; è conosciuto soltanto in Egitto dalla Valle del Nilo a sud a Luxor. Essa è strettamente legata a diverse specie Afrotropicali.