Malgrado il Deserto Occidentale sia essenzialmente un piatto altopiano roccioso, una gran parte della sua vasta estensione è coperta da sabbia eoliana (a vento soffiato) e dal Grande Mare di Sabbia d'Egitto che è parte di una delle aree largamente coperte di sabbia sulla terra.
Il Grande Mare di Sabbia si estende dal confine libico a ovest dell'oasi Siwa generalmente nella direzione sud, toccando le oasi del Farafra e del Dakhla a est e terminando al Gilf Kebir alla sua punta più meridionale.
Le dune sabbiose, che coprono gran parte del Deserto Occidentale, hanno una varietà di forme e di complessità che dipendono dal regime di vento e dall'abbondanza di sabbia. Nel nord, predominano le dune longitudinali note come Seif (spada) o irq, mentre a sud sono più comuni barchan o le dune a forma di mezzaluna. Si trovano alcune altre forme, come ad esempio i complessi delle parallele dune ondulate, ma sono meno comuni. Le dune si muovono a un tasso più o meno fisso nella direzione del vento prevalente. Così, le dita più meridionali del Grande Mare di Sabbia stanno invadendo gli uadi del Gilf Kebir.
Tra le larghe dune longitudinali (Seif) ci sono spesso valli tra le dune che possono sopportare una ricchezza di vita animale e vegetale. I tipi mobili delle dune sono meno ben forniti con la fauna selvatica. I tumuli fitogenici, che formano tali rotonde piante come le specie: Nitraria retusa, Calligonum comosum o Tamarice, aggiungono molto a questa diversità dell'habitat e creano nicchie per gli animali e per gli uccelli.
La distesa priva d'acqua per questo deserto costituisce una sede di un assemblaggio degli animali che sono ben adattati a vivere senza acqua e a ottenere la loro umidità dal loro cibo. Molti animali hanno evoluto caratteristiche comportamentali o morfologiche che consentano loro di sopravvivere il clima estremamente caldo o la locomozione sulla sabbia liscia. La ceraste (Cerastes vipera),che può essere facilmente confusa con i tipi senza corna della ceraste cornuta (Cerastes cerastes), si trova soltanto negli habitat sabbiosi. Un altro abitante della sabbia è il pesce della sabbia (Scincus scincus), così chiamato a causa della sua abitudine di "nuotare" attraverso la sabbia.
Un certo numero di uccelli abitano le sabbie soprattutto l'Allodola beccocurvo (Alaemon alaudipes), che è facilmente distinguibile dalle altre Allodole con il lungo becco leggermente curvo che dà il suo nome e anche con la sua notevole mostra di volo.
I mammiferi della regione includono la gazzella bianca o gazzella dalle corna sottili (Gazella leptoceros) estremamente rara. Questo animale vive in gran parte su tali piante come Nitraria retusa, Cornulaca monacantha e Calligonum comosum.
Un animale immensamente attraente della sabbia è il piccolo fennec (Vulpes zerda), che può essere uno dei carnivori più adatti al deserto nel mondo. Essi scavano cunicoli piuttosto profondi in modo che l'esposizione al calore durante il giorno sia ridotta al minimo e sembri essere gli unici carnivori desertici che possono vivere totalmente senza acqua. A sud-ovest del Grande Mare di Sabbia, immediatamente a nord del Gilf Kebir, si trova il curioso fenomeno noto come il vetro siliceo del deserto libico. I pezzi di vetro potrebbero essere di colore verde chiaro o cremoso, potrebbero essere trasparenti o opachi e pesano da pochi grammi a sette o otto chilogrammi.
Questi bei pezzi di vetro, situati tra le dune di sabbia, sono formazioni naturali;
Durante la maggior parte del ventesimo secolo, gli studi non sono riusciti a rivelare la loro origine. Nel 1998, si è scoperto che un gigante scarabeo verde calcareo, il centro del cerimoniale pettorale ingioiellato del re Tutankhamon, non è stato fatto, come era stato precedentemente pensato, di calcedonio, ma è stato il vetro siliceo del deserto libico.
