Le barriere coralline sono tra i più importanti di tutti gli habitat marini; il Mar Rosso offre le condizioni ambientali ideali per i coralli sassosi di cui oltre 200 specie si trovano in questo mare semi-chiuso. Gli scaffali superficiali confinanti il mare garantiscono una sufficiente luce per fare la calcificazione e la fotosintesi nelle alghe su cui alimentano alcuni polipi. I coralli ramificati più delicati prosperano nelle acque poco profonde e ben illuminate. I coralli più compatti fanno bene nelle acque più profonde e sono capaci di più di tollerare i sedimenti sospesi, che tagliano la luce disponibile verso il basso e inclinano a intasare i piccoli polipi. I coralli, che sono più efficienti nella pulizia del sedimento, fanno meglio nelle aree della sedimentazione relativamente elevata.
Le alghe simbiotiche che crescono solo sui coralli vivi producono una parte del cibo che i polipi ne hanno bisogno. Le altre alghe crescenti sulle facce dei coralli sono cibo per i pesci erbivori e per le altre creature.
La maggior parte dei coralli sassosi sono costruttori, generalmente coloniali, della barriera corallina. Ogni polipo costruisce uno scheletro; e l'animale si siede in una tazza calcarea, o in una teca, che ha segregato. I polipi sono collegati tra loro da un prolungamento del corpo sopra il livello dello scheletro. Così, la colonia si siede sulla superficie dello scheletro. In alcune specie, i polipi sono ampiamente separati e formano delle strutture ramificate; altri sono vicini gli uni agli altri e hanno pareti tecali in comune.
I polipi del corallo si riproducono per mezzo della gemmazione asessuale, al fine di formare e di ingrandire la colonia; perciò le colonie possono spesso estendersi su vaste aree. Il tasso di crescita per alcuni coralli sassosi può essere così basso come 1 centimetro l'anno; tuttavia, il tasso a cui le colonie del corallo cresce dipende dal tipo di corallo, l'ubicazione e la quantità del sole che ricevono. Alcuni coralli crescono a un tasso del 20-25 centimetri l'anno nelle ottime condizioni. Altri sono a crescita lenta a 4-5 centimetri l'anno sotto le ottime condizioni. Nelle condizioni normali, questi tassi sono dimezzati. La rottura di pochi centimetri di un corallo per prenderlo come un souvenir potrebbe significare la rottura di molti anni di crescita.
Le barriere coralline forniscono habitat per molti animali e piante. Essi costituiscono una nicchia ecologica in cui le creature possono vivere, alimentarsi e rifugiarsi dai predatori. I crostacei, i vermi, le stelle di mare, e il pesce tutti beneficiano dall'ecosistema della barriera corallina.
Le piante acquatiche sono chiamate erbe di mare; perché crescono in piccoli tappeti erbosi o prati e anche per le lunghe foglie, simili all'erba, di molte specie; queste piante acquatiche sono strettamente più collegate alle brasche che all'enorme famiglia delle erbe. I letti dell'era del mare si verificano sugli superficiali scaffali costieri del Mar Rosso e contengono undici del numero limitato delle specie conosciute in tutto il mondo. A causa della mancanza relativa di un adeguato habitat superficiale e sedimentario, il numero e le dimensioni di questi letti sono limitati.
Tuttavia, l'importanza ecologica delle erbe del mare può essere paragonabile a quella delle barriere coralline perché sono tra gli ecosistemi marini più ricchi e più produttivi.
Nel Golfo di Aqaba, 49 specie degli invertebrati sono state trovate viventi nei letti dell'erba del mare, di cui circa il 70% sono stati molluschi. Circa il 9% delle specie viventi in questi letti non sono state trovate in nessun altro habitat. I letti dell'erba del mare sono importanti fornitori del cibo, del riparo e della protezione per il novellame delle varie specie del pesce e dei crostacei commercialmente importanti e sono l'unica fonte del cibo per la Tartaruga verde (Chelonia mydas) e per il dugongo (dugongo dugon).
Sembra che la dieta di questo grande mammifero marino è costituita interamente e unicamente di una specie dell'erba del mare, ossia (Halodule uninervis). Essa tira fuori l'erba, utilizzando le sue pinne e la rende in parecchie pile; poi mangia le pile in ordine più o meno seriale.
Le acque al largo: i coralli e i letti dell'erba del mare sono trovati nelle acque superficiali del Mar Rosso, ma le acque più profonde sono anche sede di una grande diversità dei pesci che si nutrono di plancton, di invertebrati o di ogni altro. I massimi e i notissimi, tra questi, sono gli squali delle diverse specie che si trovano in questa zona. I cetacei sono anche comuni nelle acque egiziane e comprendono il grampo (Grampus grisou), e la balenottera di Eden (Balaenoptera edeni).
