Le montagne spettacolari e gli uadi del Sinai del Sud richiedono fino a circa un terzo della penisola. Al cuore di queste montagne è il Protettorato di Santa Caterina in cui ci sono le vette più alte in Egitto. La montagna più alta è Gebel Caterina (2641m).
Le montagne sono segnate con gli uadi che drenano verso est fino al Golfo di Aqaba o a ovest a Sahl El Qa e al Golfo di Suez. Malgrado le precipitazioni medie siano appena 62 millimetri ogni anno, sono superiori a 300 millimetri di tanto in tanto sulle vette più alte dove si precipitano principalmente come neve. È l'unico posto in Egitto dove c'è neve nell'inverno. La temperatura può scendere al livello più basso di -10°C.
Come con altri terreni di montagna in Egitto, le inondazioni torrenziali spesso denudano i fondi stretti dalla vegetazione. Nonostante ciò, la relativa abbondanza di precipitazioni e di un certo numero di sorgenti negli uadi supportano una ricca diversità di flora e fauna comprendendo oltre il 50% di tutte le piante endemiche in Egitto. Tra le endemiche è la rosa minacciata del Sinai Rose (Rosa Arabica). C'è una pianta rara nel Sinai, ma non è endemica: è Rubus sanctus; è tradizionalmente il roveto ardente della Bibbia.
Il fringuello del Sinai (Carpodacus synoicus) che, nonostante il suo nome, ha la sua principale area di distribuzione nell'Asia centrale, e lo Storno di Tristram (Onycognathus tristramii), tutti e due si trovano, in Egitto, solo in questa regione.
Il Gipeto (Gypaetus barbatus) sta diventando sempre più raro mediante la gamma del suo mondo, ma probabilmente si alleva qui in numeri esigui.
L'Uromastice: Lucertola dalla coda spinosa (Uromastyx ornata) che abita nei pendii rocciosi e nelle montagne, è un parente più piccolo e di colore più brillante del Dhab: Lucertola egiziana dalla coda spinosa (Uromastyx aegyptia), un abitante delle pianure sabbiose e degli uadi. Il colubro fasciato del Sinai (Coluber Sinai) e il Serpente gatto (Telescopus hoogstraali) sono endemici al Sinai. Anche qui, è estremamente velenosa la Vipera Palestina (Atractaspis microlepidota) che è senza dubbio il serpente più pericoloso nella regione e non si trova altrove in Egitto.
Il Quercino (Eliomys quercinus) è un membro della fauna locale ed è talvolta chiamato il "Bandito" in riferimento alla maschera nera sugli occhi. Questo affascinante Quercino piccolo smentisce il suo aspetto di essere piuttosto aggressivo ed è ben disposto a difendersi con i suoi denti appuntiti. Malgrado la volpe di Blanford (Vulpes cana) sia conosciuta dal Lontano Oriente (Pakistan e Iran tra gli altri paesi) per un lungo periodo, questa bella volpe piccola, dalla coda cespugliosa è stata solo nota di essere nel Sinai fin dai primi anni 1980. Una piccola popolazione del lupo (Canis lupus) è stata recentemente documentata nella regione.
Il leopardo del Sinai (Panthera pardus jarvisi), molto raro e minacciato d'estinzione, può essere ancora esistente in un numero esiguo.
Così come la sua ricca fauna e la flora, il sud del Sinai ha una ricchezza culturale e una storia religiosa, compreso il sito del Monastero della Santa Caterina, occupato dai cristiani almeno dagli inizi IV secolo. È stato suggerito che Wadi Feiran può essere stato la sede degli Amaleciti, negli inizi dei tempi biblici.
